生物晶片(Biochip)影像分析系統
我們擁有豐富的業界研發經驗及產學合作研發經驗,『生物晶片影像分析系統(Biochip Image Analyzer)』是依據瀚生醫電公司的需求進行客製化研發的產學合作計畫案,其成果無論是準確度及功能皆優於國際大廠的GenePix知名軟體,如表一所示我們的系統無論是極低品質、高品質或是故意用低通濾波器模糊化邊界的影像,其Bad Spots數目皆比GenePix低,且圈點的位置或圈點的大小的精準度也都比GenePix高。
圖ㄧ~七顯示我們的系統在處理Cyto-A生物晶片影像(每張影像含有39,200個Spots)時優越的圈點能力及分析功能的表現,特別是我們的系統對於極低品質的影像的辨識率遠高於GenePix,例如使用我們的方法的Bad Spots數目為880(圖八),而GenePix的Bad Spots數則高達3921(圖九),此外對於故意用濾波器濾波後的影像使用我們的系統(圖十)做分析,無論是『圈點的位置』或『圈點的大小』都依然非常準確,精準度都比GenePix(圖十一)高出許多,反之GenePix對於故意用低通濾波器模糊化邊界後的影像的『圈點的位置』或『圈點的大小』的準確度都變得很差,顯示我們的系統非常強健(Robust),亦即我們所開發的系統讓台灣廠商的產品能與世界大廠競爭。
此外,我們有豐富的跨平台研發經驗,無論是macOS、Android、iOS、Linux、Windows等作業系統,都可以迅速開發或移植到任意作業系統上執行,讓台灣的廠商能掌握市場先機,迅速推出最具競爭力的產品,例如圖一~十一為在macOS下執行的畫面,而圖十二~十五則分別為在Android平板、iPad平板、Linux、Windwos等系統下執行的畫面。
表ㄧ、我們的方法與GenePix 6.0的Bad Spots數比較
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Our Method |
GenePix 6.0 |
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Image Quality |
Bad Spots |
Bad Spots |
1 |
Raw (Low S/N) |
880 |
3921 |
2 |
Raw (High S/N) |
344 |
635 |
3 |
Bilateral filtered |
352 |
944 |
4 |
Raw (High S/N) |
374 |
604 |
5 |
Bilateral filtered |
387 |
869 |
6 |
Raw |
456 |
868 |
7 |
Bilateral filtered |
401 |
817 |
8 |
Median 3×3 filtered |
420 |
672 |
9 |
Median 5×5 filtered |
436 |
1354 |
10 |
Raw |
467 |
848 |
圖ㄧ~十五、我們的系統的執行畫面及與GenePix的執行結果的比較
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